Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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