Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PUDPQ08623 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms