Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms