Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB2P29033 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB2P29033 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB2P29033 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB2P29033 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB2P29033 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB2P29033 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB2P29033 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB2P29033 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB2P29033 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB2P29033 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB2P29033 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB2P29033 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB2P29033 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB2P29033 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB2P29033 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB2P29033 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB2P29033 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB2P29033 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB2P29033 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB2P29033 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB2P29033 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB2P29033 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJB2P29033 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJB2P29033 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJB2P29033 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJB2P29033 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJB2P29033 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB2P29033 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB2P29033 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GJB2P29033 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB2P29033 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GJB2P29033 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB2P29033 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB2P29033 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB2P29033 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB2P29033 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB2P29033 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GJB2P29033 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB2P29033 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GJB2P29033 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJB2P29033 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB2P29033 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJB2P29033 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJB2P29033 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB2P29033 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJB2P29033 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GJB2P29033 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB2P29033 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB2P29033 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB2P29033 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB2P29033 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB2P29033 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB2P29033 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB2P29033 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB2P29033 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB2P29033 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB2P29033 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB2P29033 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB2P29033 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB2P29033 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB2P29033 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB2P29033 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB2P29033 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB2P29033 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB2P29033 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB2P29033 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB2P29033 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms