Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms