Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms