Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms