Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.992e-13■■■■■ 158.6
UTP3Q9NQZ2 ACTN1-212ENST00000554158 571 ntTSL 48.66□□□□□ -1.022e-13■■■■■ 158.6
UTP3Q9NQZ2 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.262e-13■■■■■ 158.6
UTP3Q9NQZ2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.125e-8■■■■■ 158.6
UTP3Q9NQZ2 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.078e-7■■■■■ 158.5
UTP3Q9NQZ2 MYO18A-203ENST00000528322 549 ntTSL 419.19■□□□□ 0.669e-7■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 MYO18A-216ENST00000533420 1168 ntTSL 515.24■□□□□ 0.039e-7■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 EGLN2-208ENST00000593972 935 ntTSL 226.2■■□□□ 1.787e-24■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 ERI1-205ENST00000520684 828 ntTSL 524.93■■□□□ 1.587e-24■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 ERI1-206ENST00000521844 557 ntTSL 424.82■■□□□ 1.567e-24■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 EGLN2-203ENST00000593397 572 ntTSL 224.57■■□□□ 1.527e-24■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 EGLN2-210ENST00000594380 597 ntTSL 424.57■■□□□ 1.527e-24■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 EGLN2-215ENST00000598654 590 ntTSL 323.99■■□□□ 1.437e-24■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 GADD45A-204ENST00000484245 688 ntTSL 1 (best)22.98■■□□□ 1.277e-24■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.717e-24■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 EGLN2-206ENST00000593525 709 ntTSL 319■□□□□ 0.637e-24■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 PLXNB2-211ENST00000492578 644 ntTSL 418.63■□□□□ 0.577e-24■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 EGLN2-217ENST00000601733 584 ntTSL 418.1■□□□□ 0.497e-24■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 TMEM43-202ENST00000432444 908 ntTSL 317.17■□□□□ 0.344e-8■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 PIGQ-224ENST00000638143 563 ntTSL 516.91■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 RPL13A-211ENST00000486930 652 ntTSL 316.51■□□□□ 0.235e-23■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 PLXNB2-204ENST00000427829 567 ntTSL 415.58■□□□□ 0.087e-24■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 EGLN2-213ENST00000596517 574 ntTSL 415.17■□□□□ 0.027e-24■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.087e-24■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 EHD1-209ENST00000484846 3469 ntTSL 214.52□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 ERI1-201ENST00000250263 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.197e-24■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 ATP6V1G2-DDX39B-203ENST00000480131 552 ntAPPRIS P1 TSL 411.99□□□□□ -0.497e-24■■■■■ 158.4
UTP3Q9NQZ2 IMMP2L-209ENST00000489381 856 ntTSL 58.75□□□□□ -1.013e-7■■■■■ 158.3
UTP3Q9NQZ2 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.363e-7■■■■■ 158.3
UTP3Q9NQZ2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 158.3
UTP3Q9NQZ2 PRDM15-204ENST00000433067 6124 ntTSL 516.62■□□□□ 0.253e-8■■■■■ 158.2
UTP3Q9NQZ2 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.223e-8■■■■■ 158.2
UTP3Q9NQZ2 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.133e-8■■■■■ 158.2
UTP3Q9NQZ2 PRDM15-206ENST00000447016 4992 ntTSL 1 (best)15.74■□□□□ 0.113e-8■■■■■ 158.2
UTP3Q9NQZ2 PRDM15-215ENST00000495217 703 ntTSL 313.67□□□□□ -0.223e-8■■■■■ 158.2
UTP3Q9NQZ2 PRDM15-202ENST00000398548 6654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.393e-8■■■■■ 158.2
UTP3Q9NQZ2 PRDM15-208ENST00000449395 6662 ntTSL 1 (best)12.41□□□□□ -0.423e-8■■■■■ 158.2
UTP3Q9NQZ2 PRDM15-205ENST00000441787 6542 ntTSL 1 (best)12.35□□□□□ -0.433e-8■■■■■ 158.2
UTP3Q9NQZ2 PRDM15-203ENST00000422911 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.473e-8■■■■■ 158.2
UTP3Q9NQZ2 PRDM15-212ENST00000486812 7072 ntTSL 1 (best)11.93□□□□□ -0.53e-8■■■■■ 158.2
UTP3Q9NQZ2 GAS8-219ENST00000569558 3856 ntTSL 210.84□□□□□ -0.679e-7■■■■■ 158.1
UTP3Q9NQZ2 TCF20-204ENST00000515426 633 ntTSL 518.12■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 158.1
UTP3Q9NQZ2 CELF1-213ENST00000530151 583 ntTSL 323.26■■□□□ 1.317e-7■■■■■ 158.1
UTP3Q9NQZ2 CELF1-208ENST00000525841 622 ntTSL 515.86■□□□□ 0.137e-7■■■■■ 158.1
UTP3Q9NQZ2 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 158
UTP3Q9NQZ2 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 158
UTP3Q9NQZ2 CSNK1G1-207ENST00000634654 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.314e-7■■■■■ 158
UTP3Q9NQZ2 CSNK1G1-201ENST00000303052 8179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 158
UTP3Q9NQZ2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.741e-7■■■■■ 158
UTP3Q9NQZ2 PPP2R5C-222ENST00000556570 477 ntTSL 57.57□□□□□ -1.23e-13■■■■■ 158
UTP3Q9NQZ2 ABCC1-204ENST00000572882 4565 ntTSL 1 (best)11.5□□□□□ -0.571e-6■■■■■ 157.9
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-215ENST00000623163 851 ntTSL 515.16■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 157.8
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 157.8
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-212ENST00000589187 568 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 157.8
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 157.8
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-217ENST00000623650 886 ntTSL 59.88□□□□□ -0.833e-6■■■■■ 157.8
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-220ENST00000624128 672 ntTSL 29.84□□□□□ -0.833e-6■■■■■ 157.8
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-218ENST00000623901 711 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -13e-6■■■■■ 157.8
UTP3Q9NQZ2 AC087289.3-202ENST00000593156 4270 ntTSL 213.08□□□□□ -0.315e-15■■■■■ 157.8
UTP3Q9NQZ2 TRIP12-215ENST00000479037 2938 ntTSL 1 (best)15.06■□□□□ 09e-8■■■■■ 157.8
UTP3Q9NQZ2 TRIP12-203ENST00000389044 6405 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.439e-8■■■■■ 157.8
UTP3Q9NQZ2 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.079e-8■■■■■ 157.8
UTP3Q9NQZ2 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.39e-8■■■■■ 157.8
UTP3Q9NQZ2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.54e-6■■■■■ 157.8
UTP3Q9NQZ2 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.054e-6■■■■■ 157.8
UTP3Q9NQZ2 GDPD5-206ENST00000527820 3211 ntTSL 1 (best)14.23□□□□□ -0.134e-6■■■■■ 157.8
UTP3Q9NQZ2 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.134e-6■■■■■ 157.8
UTP3Q9NQZ2 PFKL-207ENST00000474114 6007 ntTSL 1 (best)21.85■■□□□ 1.098e-8■■■■■ 157.7
UTP3Q9NQZ2 CYTH1-206ENST00000586299 4423 nt15.94■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 157.7
UTP3Q9NQZ2 STK24-207ENST00000491878 547 ntTSL 415.89■□□□□ 0.139e-7■■■■■ 157.7
UTP3Q9NQZ2 CBFA2T3-207ENST00000564416 399 ntTSL 516.29■□□□□ 0.27e-7■■■■■ 157.6
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP2-216ENST00000483412 6235 ntTSL 1 (best)11.32□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 157.5
UTP3Q9NQZ2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.426e-7■■■■■ 157.5
UTP3Q9NQZ2 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.26e-7■■■■■ 157.5
UTP3Q9NQZ2 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.089e-9■■■■■ 157.3
UTP3Q9NQZ2 CELF1-203ENST00000361904 1580 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.69e-9■■■■■ 157.3
UTP3Q9NQZ2 CELF1-205ENST00000395292 2191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.849e-9■■■■■ 157.3
UTP3Q9NQZ2 CELF1-202ENST00000358597 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.959e-9■■■■■ 157.3
UTP3Q9NQZ2 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.227e-7■■■■■ 157.3
UTP3Q9NQZ2 SNRNP200-203ENST00000480242 3409 ntTSL 29.03□□□□□ -0.963e-10■■■■■ 157.3
UTP3Q9NQZ2 SIN3A-208ENST00000567289 4078 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.321e-17■■■■■ 157.3
UTP3Q9NQZ2 NT5DC2-208ENST00000471522 582 ntTSL 313.93□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 157.2
UTP3Q9NQZ2 NT5DC2-211ENST00000486792 419 ntTSL 310.1□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 157.2
UTP3Q9NQZ2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.951e-6■■■■■ 157.2
UTP3Q9NQZ2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.841e-6■■■■■ 157.2
UTP3Q9NQZ2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.272e-6■■■■■ 157.1
UTP3Q9NQZ2 PRMT9-204ENST00000514886 2674 ntTSL 219.89■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 157.1
UTP3Q9NQZ2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.75e-8■■■■■ 157.1
UTP3Q9NQZ2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.75e-8■■■■■ 157.1
UTP3Q9NQZ2 ZFAND2A-202ENST00000397083 852 ntTSL 1 (best)19.43■□□□□ 0.75e-8■■■■■ 157.1
UTP3Q9NQZ2 ZFAND2A-206ENST00000484977 1084 ntTSL 217.86■□□□□ 0.455e-8■■■■■ 157.1
UTP3Q9NQZ2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 157.1
UTP3Q9NQZ2 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 157.1
UTP3Q9NQZ2 ERCC1-204ENST00000423698 3119 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 157.1
UTP3Q9NQZ2 ERCC1-202ENST00000300853 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 157.1
UTP3Q9NQZ2 PRPF4B-203ENST00000463634 2590 ntTSL 58.8□□□□□ -12e-6■■■■■ 157.1
UTP3Q9NQZ2 SPTB-208ENST00000556626 10153 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 157.1
UTP3Q9NQZ2 SMPD4-207ENST00000435455 842 ntTSL 517.31■□□□□ 0.361e-14■■■■■ 157
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 1497.1 ms