Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms