Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ1

CD300LF, CMRF35-like molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300LFQ8TDQ1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300LFQ8TDQ1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms