Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGSM1Q2NKQ1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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