Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms