Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP1P63208 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP1P63208 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP1P63208 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms