Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRG2P13727 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms