Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VAPBO95292 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPBO95292 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPBO95292 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPBO95292 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms