Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM149AA5PLN7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms