Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CNPPD1Q9BV87 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms