Protein–RNA interactions for Protein: Q99578

RIT2, GTP-binding protein Rit2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT2Q99578 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIT2Q99578 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIT2Q99578 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RIT2Q99578 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIT2Q99578 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIT2Q99578 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIT2Q99578 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIT2Q99578 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIT2Q99578 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIT2Q99578 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIT2Q99578 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIT2Q99578 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIT2Q99578 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIT2Q99578 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIT2Q99578 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIT2Q99578 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIT2Q99578 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIT2Q99578 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RIT2Q99578 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RIT2Q99578 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RIT2Q99578 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RIT2Q99578 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIT2Q99578 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms