Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIN3AQ96ST3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms