Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ELN-201ENST00000252034 3781 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms