Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CTF1Q16619 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CTF1Q16619 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CTF1Q16619 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CTF1Q16619 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CTF1Q16619 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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