Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms