Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms