Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms