Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNQ1P51787 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1P51787 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1P51787 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1P51787 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1P51787 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1P51787 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1P51787 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1P51787 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1P51787 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1P51787 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1P51787 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1P51787 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1P51787 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1P51787 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1P51787 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1P51787 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1P51787 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1P51787 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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