Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCR4P51679 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCR4P51679 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCR4P51679 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCR4P51679 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CCR4P51679 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCR4P51679 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms