Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM1P49642 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms