Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA2P47869 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms