Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPOP42166 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPOP42166 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPOP42166 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPOP42166 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPOP42166 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPOP42166 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPOP42166 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPOP42166 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPOP42166 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPOP42166 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPOP42166 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPOP42166 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPOP42166 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPOP42166 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPOP42166 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPOP42166 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPOP42166 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPOP42166 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPOP42166 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPOP42166 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPOP42166 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPOP42166 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPOP42166 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPOP42166 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPOP42166 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPOP42166 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPOP42166 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPOP42166 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPOP42166 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPOP42166 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPOP42166 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPOP42166 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPOP42166 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPOP42166 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPOP42166 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPOP42166 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPOP42166 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPOP42166 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPOP42166 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPOP42166 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPOP42166 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPOP42166 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPOP42166 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPOP42166 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPOP42166 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms