Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms