Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms