Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCEO43556 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCEO43556 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCEO43556 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCEO43556 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCEO43556 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms