Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNMO15061 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNMO15061 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNMO15061 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNMO15061 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNMO15061 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNMO15061 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNMO15061 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNMO15061 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNMO15061 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNMO15061 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNMO15061 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNMO15061 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNMO15061 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNMO15061 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNMO15061 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNMO15061 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNMO15061 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNMO15061 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNMO15061 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNMO15061 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNMO15061 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNMO15061 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNMO15061 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNMO15061 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNMO15061 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNMO15061 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNMO15061 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNMO15061 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNMO15061 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNMO15061 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNMO15061 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNMO15061 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNMO15061 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNMO15061 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNMO15061 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNMO15061 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNMO15061 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNMO15061 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNMO15061 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNMO15061 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNMO15061 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNMO15061 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNMO15061 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNMO15061 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNMO15061 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNMO15061 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNMO15061 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNMO15061 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNMO15061 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNMO15061 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNMO15061 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNMO15061 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNMO15061 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNMO15061 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNMO15061 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNMO15061 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNMO15061 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNMO15061 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNMO15061 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNMO15061 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNMO15061 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNMO15061 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNMO15061 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNMO15061 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNMO15061 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNMO15061 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNMO15061 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNMO15061 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNMO15061 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNMO15061 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNMO15061 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNMO15061 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNMO15061 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNMO15061 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNMO15061 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNMO15061 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms