Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms