Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAN1Q9Y2M0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAN1Q9Y2M0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms