Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM35Q9UPQ4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms