Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LAMTOR3Q9UHA4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms