Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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