Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms