Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms