Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms