Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms