Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3CQ9BUI4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms