Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GAL3ST1Q99999 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms