Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms