Protein–RNA interactions for Protein: Q96GZ6

SLC41A3, Solute carrier family 41 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A3Q96GZ6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A3Q96GZ6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms