Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms