Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USF2Q15853 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USF2Q15853 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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