Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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TRIP13Q15645 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms