Protein–RNA interactions for Protein: Q01546

KRT76, Keratin, type II cytoskeletal 2 oral, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT76Q01546 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT76Q01546 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT76Q01546 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms